3歲寶寶早上起來咳嗽可能有以下幾個原因：

1. 咳嗽是身體的一種自我保護機制，可能是寶寶的呼吸道受到了刺激。早上起床后，室內(nèi)空氣可能較為干燥，或者存在灰塵、花粉等過敏原，這些刺激物可能引起寶寶咳嗽。

2. 寶寶可能感染了呼吸道疾病，如感冒、喉嚨炎等。這些疾病常常表現(xiàn)為咳嗽、鼻塞、喉嚨痛等癥狀。早上咳嗽可能是因為寶寶躺在床上時間較長，呼吸道分泌物積聚較多，刺激咳嗽反射。

3. 寶寶可能有過敏性疾病，如哮喘、過敏性鼻炎等。早上起床時，寶寶可能接觸到過敏原，如塵螨、寵物毛發(fā)等，導致過敏反應，引發(fā)咳嗽。

4. 寶寶可能有胃食管反流病。這種病癥會導致胃酸倒流到食管，刺激食管黏膜，引起咳嗽。

如果寶寶早上起來咳嗽，可以嘗試以下措施緩解癥狀：保持室內(nèi)空氣濕潤，定期清潔房間，避免寶寶接觸過敏原，保持寶寶飲食規(guī)律，避免辛辣食物和過度進食。如果癥狀持續(xù)或加重，建議及時就醫(yī)，尋求醫(yī)生的指導和治療。